Re: [問卦] 基因定序的原理？

※ 引述《fifthfloorme (躌艛)》之銘言：
: 標題: [問卦] 基因定序的原理？
: 時間: Wed Sep 8 14:44:42 2021
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: 小妹文組，想問基因定序為什麼要那麼多天？
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: 我以為就是把基因拿去顯微鏡底下觀察一下欸！生物課不是都有萃取過DNA嗎？
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: 還是說，要放大很多倍才能看得清楚序列呢？求解！

關於基因檢測的相關全條目，初版是我10年前寫的，好像沒被其他編輯者改多少:
https://reurl.cc/EZK4eA

基因定序
https://reurl.cc/aNlLDX

歡迎內行的各位幫忙編修~ ^^

這邊我要挑一點特別提出來給各位版友認識，基因定序之父是台灣人: 陳弈雄博士

: → Goog1e: 生物課萃取DNA?????? 150.116.147.25 09/08 14:45現在的萃取DNA實驗，已經到小學生自然課就有做過了喔~
: 推 Neisseria: 用定序儀跑的。要跑一至兩週 112.105.246.64 09/08 14:48不用，純做實驗、上機跑數據的話，一天以內(正確來說，幾小時內)就出來了~

整個過程最花時間的是採樣送件及確認受檢者的"跑病例流程"階段。 <=人文的

問題永遠比做科學的實驗還複雜。

現在科技進步很快，基因定序儀已經到第四代了，一個人的"全基因圖譜"才需要

跑到幾天。

: → SRadiant: 跑1、2週是20年前的事吧... 111.82.244.251 09/08 14:4910年前的事.... 20年前是多個國家，上百的研究團隊跑了數年。

現在科技進步很快的。 ^^

: 推 vaya: 推 要用電顯。 選我正姐 39.11.36.226 09/08 14:51電顯也看不到"分子"層次，DNA可是分子鏈....

: 推 owlonoak: 20年前還沒有完全定序這種技術 220.143.192.200 09/08 14:51嗯.... 也不是這麼說......

: 推 Neisseria: 所以現在定序要多久？一至三天？ 112.105.246.64 09/08 14:52做實驗不用，但整個流程(含採檢、送樣、實驗、上機、出報告....等全部)可能要。

: 推 LukaDoncic: 要先RT 再PCR 再送NGS 再用程式分析se 35.130.71.243 09/08 14:52RT跟PCR是一起的.... 而且真有需要用到RT?

: → SRadiant: 記什麼，因為有3萬個左右所以要花一些 111.82.244.251 09/08 14:52: → SRadiant: 時間 111.82.244.251 09/08 14:52: → LukaDoncic: quence 可能還要重複幾次 35.130.71.243 09/08 14:52: 推 scps990607: 搜尋「次世代定序NGS」了解一下 27.242.135.137 09/08 14:53GJ ^^
: 推 kavengany: DNA電泳慢慢跑 223.139.161.184 09/08 14:53這實驗不用跑電泳。
: 推 gn01657736: DNA才問世30年，技術還不成熟一堆文 49.217.198.4 09/08 14:53看你說的技術是哪種... 比如剪接的技術確實還不純熟(基因治療)。

但論定序，它的發展已經很久、很熟了。

: → gn01657736: 組，ATGC就一堆人就看不懂了 49.217.198.4 09/08 14:53: → SRadiant: 病毒幾萬個鹼基完整定序沒問題啊 111.82.244.251 09/08 14:54沒錯~ 不過PCR永遠有個問題，就是在複製的時候會出錯。

: 推 owlonoak: 其實上面有一個鄉民還真的說對了 220.143.192.200 09/08 14:54: → owlonoak: 真的是叫DNA排好報數 220.143.192.200 09/08 14:54: → owlonoak: 是長度從一個鹼基到最後一個鹼基這樣 220.143.192.200 09/08 14:55: → owlonoak: 檢查這一堆長度不等的DNA的最末端鹼基 220.143.192.200 09/08 14:55: → owlonoak: 這就是目前定序的原理 220.143.192.200 09/08 14:56: → SRadiant: NGS出來也快20年囉，2003年就有發表一 111.82.244.251 09/08 14:56: → SRadiant: 個腺病毒全基因組 111.82.244.251 09/08 14:5710年
: 推 duckie: Sanger定序法 應該不會用到NGS 60.251.121.124 09/08 14:57: → duckie: NGS太貴了 60.251.121.124 09/08 14:57你內行!!

: 推 pastoris: 採後萃取蛋白質體，用delta序列當引子作 150.116.67.54 09/08 14:58: → pastoris: PCR，結果sequence分析 150.116.67.54 09/08 14:58...... 翠蛋白質體???? 你確定???? (@[email protected])?

: → SRadiant: 病毒基因體很小，不貴，而且公家的錢 111.82.244.251 09/08 14:58只要做分子實驗，沒有不貴的~

: 推 pastoris: 那會用什麼作primer夾出來？ 150.116.67.54 09/08 15:03: → SRadiant: https://i.imgur.com/oKP7BNV.jpg 111.82.244.251 09/08 15:03

: → SRadiant: 台灣不知不覺也上傳一堆序列了，剛剛還 111.82.244.251 09/08 15:04: → SRadiant: 看到有人說定序會不會造假... 111.82.244.251 09/08 15:04: → SRadiant: https://i.imgur.com/7SnEEYq.jpg 111.82.244.251 09/08 15:04: → SRadiant: 有些資訊比較齊全的，會有定序技術，像 111.82.244.251 09/08 15:05: → SRadiant: 這個是用Illumina Iseq 111.82.244.251 09/08 15:05: → SRadiant: Illumina iseq 100的話就是NGS 111.82.244.251 09/08 15:07你內行~ GJ~ ^,^

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※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc), 來自: 202.39.33.67 (臺灣) ※ 編輯: yabia (202.39.33.67 臺灣), 09/08/2021 15:28:41

有特定序列可以用primer夾，跑電泳切膠、PCR...等，我懂得是老套的做法，需要 ＲＮＡ的量比較大，不然光過程就被降解掉一堆了，以前做ＲＮＡ的研究的人很辛 苦。　　現在有很多ＫＩＴ可以用，不需要我懂得那種老方法了，你可以去查一查 一些廠商提供的ＲＮＡ　ＫＩＴ。

分生是現在的科科人的顯學，你生化不好好讀，分生就別想過了．．．．

喔，我以為你在談"歷史"，在講之前的人類基因體的事.... 病毒基因體小，很容易測完，但要抓有意義的片段就好，多抓的是沒意義的~ 反而干擾你做研究分析~

也對啦~ 現在是基本功了~ 時代的眼淚~ (Q_Q)

我以為已經有新產品可以替代這老方法了.... 現在還是要RT啊... (=..=) 沒有我想像中的進步得快啊....

你也不想想該內容是我10幾年前寫的~ 既然是內行人，有空幫我編修啦~

※ 編輯: yabia (202.39.33.67 臺灣), 09/08/2021 16:12:38