工作上的事可以問原因嗎

各位前輩好
去年剛成為職場新鮮人，但近期發生一個狀況讓我很不解
文有點長

大致上是這樣
1）某批工廠生產的產品數量和客戶下單落差太大，小主管請我去問工廠原因
但因為遇上對方主管開會，前後問了三位大概花三小時解決，原本第一位有先給我一個答案但小主管不滿意才繼續問後面幾位，途中也持續做自己原本手上的事情

隔天大主管直接說，都用電話處理事情、事情發生了也不能補救應該自己想辦法回覆主管、溝通的方式很重要
當下有點錯愕，意思是不要用電話直接發email嗎？（但當天下午和其他部門的會議主管卻說有什麼事情大家溝通好就好，不用一定要開會、用信件啊）還是自己呼嚨主管？（一方面覺得是小主管交代的工作，另一方面自己也想搞清楚原因）
後來想說應該是我講話的方式太冗長（會先跟對方解釋狀況），所以這幾天的電話都直奔問題，有問題就連續問

2）昨天又遇到另一個狀況
請採購詢價但採購卻回覆檔案看不懂直接丟窗口給我聯繫（請採購詢價已經過了兩週），當下馬上告知同事這樣的狀況，同事也說那就問吧。但因為覺得太浪費時間，如果是我們買那下次根本不用浪費採購的兩週，所以繼續詢問同事，以前這個商品都是我們自己買還是請採購買？（有些商品我們買有些採購買，目前還抓不出規則）
同事聽到後有點愣住，才回答以前都我們買但因為沒買過這家所以請採購…但現在…

相似的事情幾乎每週都會發生，只是部門不同，但常常事情丟來丟去都會想說乾脆自己來算了

結果昨天年末個人談話時再次被大主管提醒
1、大公司有規則不是你想怎樣就可以
但從來我都沒有想怎樣就怎樣，也基本不提意見因為知道不會被採納只會被當異議份子。只是每次跑流程都需要問同事要給誰，因為根本沒跑過，有時候問原因是因為發生狀況，想了解為什麼，下次就能避免，自己回想也不曾抱怨公司步驟繁瑣。我也承認很多文件我第一次辦，承辦人回覆後我沒檢查到對方的錯誤，導致送給主管後還要再送回承辦人，時間太趕就要麻煩趕件

2、不要窮追不捨
說真的如果是指工廠那件事那我真的很抱歉，因為過去幾年我受到的訓練就是要問原因
過程中我的口氣自認還算和善，對方也都很熱心的回答問題，就算後來發現原因是有人出錯，我也沒回頭指責對方

以上大概是事發過程
但我真的不理解，工作上的事情真的不能問原因嗎？就算出錯了就隨風去然後下次再重蹈覆徹？
追問原因可以了解問題的根本然後避免，這些事情也只有我現在沒什麼業務加上菜鳥才能換來一點對方的耐心（過程我都會很感謝對方，儘量只問一次）
而昨天到其他部門處理文件，剛好有新產品實務上的疑問，順路問了對方主管也得到很詳細的解釋，自己覺得這樣後續在和外界洽談也可以避免很多來回溝通和實務上的障礙
其實大主管還一直叮嚀要融入這個部門…但我已經不知道要怎麼融入了（買伴手禮？）
目前是覺得有疑問還是想問清楚，但打算都趁去其他部門時偷偷問了…

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